填平部分大埔船灣淡水湖作新市鎮列為概念性選項之一，惟該區區議員及居民認為水塘目前有實際功能，填平建屋將為本港帶來供水問題，爭議性大，認為應善用棕地及閒置鄉郊用地。
區議員憂 供水問題影響深遠
大埔船灣淡水湖為全球首個在海中興建的水庫，湖面面積約1,200公頃，並為全港面積最大、容量次多的水塘，佔香港水塘總存量約4成，有學者建議可填平約600公頃，預計可興建30萬伙，容納約80萬至120萬人居住。
區議員區鎮樺表示，早年為興建水塘，迫遷數條村落，若現時為了要建屋，毀掉水塘，是沒有必要，而絕大多數居民亦反對填平水塘用地，主要憂慮供水問題帶來長遠影響。
倡善用閒置鄉郊地 棕地發展
填平部分水塘用地雖可提供大面積地塊，現時香港主要依靠購買東江水，但事實上部分東江水亦需要利用水塘儲納，具有公眾實際功能，且一旦日後減購東江水或天熱乾旱時，減少水塘將會為本港供水帶來深遠影響，建議應善用區內其他郊野閒置地及棕地發展。
另大埔蕉坑及洞梓一帶現有不少農地由發展商持有，近年先後拋出橄欖枝有意發展房屋。對於公私營合作發展農地，不少居民有所保留。
大埔現時有逾100條鄉村，有居民指，區內有不少大幅偏遠鄉郊用地沒有發展正在丟空，或淪落棕地貨倉等用途，比起在市中心插針建屋，利用大片用地發展新市鎮，配合規劃提供交通及社區配套，更為理想。